A igreja tem o formato de uma cruz grega (aquela cujos braços têm o mesmo tamanho) e isso fica ainda mais bonito em vista aérea.
Numa das pontas da cruz estará o altar e as outras homenageiam as padroeiras dos países da tríplice fronteira: Nossa Senhora Aparecida, padroeira do Brasil, Nuestra Señora de Caacupé (do Paraguai) e ao sul Nuestra Señora de Lujan, voltada em direção à Argentina. As três faces terão três portas iguais, simbolizando a igualdade entre os povos que vivem nessa fronteira.
As quatro pontas da cruz grega ainda simbolizam os quatro evangelistas e os elementos da natureza (água, terra, fogo e ar).